تتشابه مصطلحات نظام المؤسسة ونظام تخطيط موارد المؤسسات ولكن هناك فرق بين نظام المؤسسة ونظام تخطيط موارد المؤسسات. نظام ES أو نظام المؤسسة هو نظام واسع النطاق يتضمن حزمًا مثل ERP و CRM. ERP هو مجموعة فرعية من Enterprise System أو يمكن القول أن ES هو مجموعة شاملة من ERP. يحتوي على مجموعة متنوعة من الحلول. يحتوي ES على تطبيقات وحلول مجمعة يمكن استخدامها مباشرة في المؤسسة. من ناحية أخرى ، فإن نظام تخطيط موارد المؤسسات هو أتمتة العمليات التجارية والحلول في شكل وحدات مصممة وفقًا لمتطلبات العميل.
يتم تخصيص الوظائف وفقًا لبيئة عمل العميل. لا يتضمن نظام المؤسسة بنية الحلول الأخرى بينما يقوم تنفيذ تخطيط موارد المؤسسات بأتمتة الأنظمة باستخدام الجوانب التقنية. يشتمل نظام تخطيط موارد المؤسسات (ERP) على هياكل وقواعد بيانات وهو عبارة عن بنية خادم العميل. النظام يعتمد على الخادم وبالتالي يحتاج المستشار إلى أن يكون على دراية بالجانب التقني أيضًا.
هناك اختلاف آخر بين نظام ES ونظام تخطيط موارد المؤسسات وهو أن تخطيط موارد المؤسسات يهدف إلى تحسين وظائف المنظمة بينما يساعد ES على تحسين الصيانة الشاملة والدقة. يوفر أفضل الحلول والمساعدات في اتخاذ القرار. ES صعب التنفيذ مقارنة بتخطيط موارد المؤسسة وحتى الإطار الزمني المطلوب للتنفيذ ربما أكثر. التأثير الإجمالي مرتفع ولكن المخاطر التي ينطوي عليها الأمر كذلك. إذا لم يتم تنفيذ ES بالطريقة الصحيحة ، فقد يتسبب ذلك في فشل الأعمال وإذا تم تنفيذه بشكل صحيح يمكن أن يزيد من كفاءة وأرباح منظمة الأعمال. عادة ما تكون مطلوبة عندما يكون هناك عيب كبير في الإجراءات والمنهجيات الحالية في المنظمة وتحتاج إلى تصحيح. تحتاج الشركة التي تعمل في نظام المؤسسة إلى توخي الحذر أثناء اختيار البرنامج والموردين نظرًا لخطر الفشل الذي ينطوي عليه الأمر.
يتمثل الاختلاف بين نظام المؤسسة ونظام تخطيط موارد المؤسسات في أن تخطيط موارد المؤسسات يستخدم في الغالب للشركات المتوسطة الحجم للشركات الكبيرة ، بينما يقتصر استخدام الخدمات البيئية على الشركات الكبيرة. هناك العديد من الوظائف المعقدة التي تشترك فيها الشركات الكبرى والتي لا يمكن توفير حلول لها بمفردها عن طريق تخطيط موارد المؤسسات يتم تقييد دور تخطيط موارد المؤسسات (ERP) عند مقارنته بنظام المؤسسة لأنه لا يتضمن علاقة العملاء أو إدارة البائعين.
هذه التطبيقات مطلوبة عندما تكون عملية الأعمال معقدة وعلى نطاق واسع. لذلك تحتاج المؤسسات الأكبر إلى التعامل مع ES بدلاً من تخطيط موارد المؤسسة وحده. يعد تخطيط موارد المؤسسات أيضًا نظامًا مهمًا لتبسيط العمليات الداخلية ولكنه لا يوفر الاهتمام بالعمليات الخارجية. يعتني نظام المؤسسة بعملية تنظيم الأعمال من البداية إلى النهاية نظرًا لأنه يتضمن تطبيقات أخرى أيضًا مثل SCM و CRM. هناك اختلاف كبير بين نظام المؤسسة ونظام تخطيط موارد المؤسسات (ERP) ويعتمد ذلك على الشركة سواء كانت تريد الذهاب مع ES لتبسيط العملية بأكملها بدءًا من التوريد والإنتاج والعميل أو ما إذا كان يريد استخدام نظام ERP لتبسيط العملية الداخلية.